Fondé en 1853 en tant que département de zoologie de l'université, le musée se trouve aujourd'hui près du "Dipartimento di Biologia Animale". Il contient les collections des professeurs et des membres de "L'Associazione Gioenia di Scienze Naturali"; de riches collections ornithologiques d'environ 1 500 exemples comprennent des espèces d'oiseaux-colibris, des perroquets, des oiseaux de paradis et de nombreuses espèces originaires de Sicile (certaines ayant une grande importance historique et scientifique). De nombreuses collections de mammifères extra-européens et d'invertébrés terrestres et marins sont exposées et occupent une place importante dans le musée, conformément à la tradition scientifique du département.