Das Benediktinerkloster wurde 1558 gegründet. Die ursprüngliche Struktur wurde aufgrund der zerstörerischen Naturereignisse, die Catania 1669 und 1693 verärgerten und einen Großteil des Gebäudes zerstörten, mehrfach umgebaut und rekonstruiert.

Der Wiederaufbau - begonnen im Jahr 1702 - sah die wichtigsten sizilianischen Architekten - Ittar, Battaglia, Battaglia Santangelo, Palazzotto - bei der Arbeit und der Giovan Battista Vaccarini, der viele der bedeutendsten Werke des sizilianischen Barocks aus dem 18. Jahrhundert unterzeichnen wird.

Neben dem Kloster gibt es einen neuen Kreuzgang, den Garten, die Caffeaos und die Räume, die für das tägliche und kollektive Leben der Mönche bestimmt sind: die Bibliothek, die Küchen, der Flügel des Noviziats, die Refektorien, der Nachtchor .

Die Kirche San Nicolò the Arena, die dem neuen Klostergebäude angegliedert ist, bleibt in der Hauptfassade unvollendet. Das Kloster wird somit zu einem der größten Klöster Europas.

Im Jahr 1866 wurde das Benediktinerkloster konfisziert, als es an die königliche Domäne ging, um dann der Gemeinde Catania anvertraut zu werden. 1977 stiftete die Gemeinde es der Universität von Catania, die es zum Hauptsitz der historischen Fakultät für Briefe und Philosophie machte.

Nach der Renovierung durch den Architekten Giancarlo De Carlo wurde das Kloster von der sizilianischen Region als zeitgenössisches Architekturwerk anerkannt. Während der Arbeiten kamen die Überreste der römischen Stadt zum Vorschein: ein gesamtes römisches Viertel, entworfen von den Achsen der Straßen Cardum und Decumanus Maximus und der Anwesenheit von Domus aus der späten hellenistischen und kaiserlichen Zeit. Die Ausgrabungen sind im Haupthof und unter den ehemaligen Stallungen zu sehen.